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Opentrons Flex NGS文库制备自动化方案

更新时间:2026/8/17 点击次数:1413

NGS 文库制备自动化方案

将建库流程中的重复移液、磁珠纯化和板间转移组织为可参数化的自动化步骤,适配从方法建立到批量样本处理的工作节奏。

内容目录

01 方案概览02 典型流程03 核心价值04 适用场景05 配置建议

一、方案概览

NGS 文库制备通常包含样本分装、试剂分配、反应体系构建、磁珠纯化、片段筛选、PCR 扩增和文库汇总等多个环节。样本数量增加时,重复移液和多次板间转移容易拉长操作时间,也会增加批间差异的控制难度。

Opentrons Flex NGS 工作站以自动化移液平台为核心,可按照不同试剂盒和实验室 SOP 对加液顺序、混匀方式、磁珠处理和板位规划进行参数化设置。对常用试剂盒,可在验证后固化为可复用流程;对探索性方法,也可保留调整空间。

Opentrons Flex NGS 自动化文库制备

二、典型自动化流程

以下为常见 NGS 文库制备的流程组织方式,具体反应条件和步骤应以所用试剂盒说明书及实验室验证结果为准。

01样本与板位规划完成样本信息、试剂槽、耗材和反应板位的配置,建立可追溯的处理批次。
02试剂分配与反应构建按设定体积加入模板、酶混合液、接头或缓冲液,并通过受控混匀降低手工操作差异。
03磁珠纯化与片段筛选执行磁珠结合、磁吸、洗涤和洗脱,按方法需要加入双侧或单侧片段筛选步骤。
04PCR 扩增与文库整理完成扩增体系分配、反应板转移和扩增后清理,为后续质控与上机前归一化做准备。
05质控与上机前准备结合实验室质控结果完成文库汇总、定量和最终转移。

三、核心价值

端到端流程组织
覆盖建库前处理中的关键液体处理步骤,减少重复手动移液。
适配多类试剂盒
可按 Illumina、IDT、Qiagen 等试剂盒与实验室 SOP 进行方法配置。
兼顾通量与灵活性
可从小批量方法建立扩展至多样本并行处理。
可追溯操作记录
按流程保留板位、参数和运行记录,便于批次复核。

NGS 自动化文库制备场景

四、适用场景与方法边界

该方案可用于 DNA、RNA、全基因组、靶向、微生物、miRNA 和单细胞相关文库制备场景的自动化前处理。

全基因组与靶向建库适用于模板分装、酶切或片段化、接头连接、PCR 与纯化等连续步骤。
RNA 与 miRNA 建库可针对小体积加液、磁珠纯化和多板并行设计流程。
高通量批处理适合需要提升批次一致性、减少人工重复操作的多样本项目。
方法开发与转移可在验证阶段保留参数调整空间,确认后固化为标准流程。

不同试剂盒对温控、混匀、磁珠比例和反应时间的要求不同,正式运行前应完成方法适配与质量验证。

五、配置与资料说明

核心平台Opentrons Flex 自动化移液工作站。
可选模块磁力架、温控、热循环、抓手和耗材堆栈按流程配置。
典型通量可支持多样本并行处理,实际通量取决于试剂盒、反应时长和质控要求。
附件资料高通量 NGS 工作站宣传资料及相关应用笔记。

可参考资料

  • 全自动化全基因组测序文库制备应用笔记

  • 高通量 NGS 工作站宣传资料

  • PacBio、Twist、QIAseq 与单细胞 RNA 测序相关流程资料

方案咨询

可根据样本类型、试剂盒和目标通量确认板位布局、模块配置和方法验证路径。

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